Trouver la bonne formation en alternance en Bourgogne-Franche-Comté suppose de croiser plusieurs critères concrets : le secteur professionnel visé, le rythme entreprise/école, la reconnaissance du diplôme et la capacité du centre à connecter ses apprentis avec le tissu économique local. On a retenu dix établissements ou organismes implantés dans la région, sélectionnés pour la diversité de leurs filières, leur ancrage territorial et les débouchés qu’ils ouvrent réellement après le contrat.
1. Groupe Alternance Dijon

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Le campus dijonnais du Groupe Alternance couvre un large spectre de formations commerciales et administratives, du BTS au mastère. Sa spécialité, c’est le commerce, le marketing et la gestion, avec un accompagnement à la recherche d’entreprise intégré au parcours d’inscription.
Ce qui le distingue : un réseau national de campus qui facilite la mobilité, et surtout un service dédié au placement en entreprise. On s’adresse ici à des profils post-bac qui veulent entrer vite dans le monde du travail via un contrat d’apprentissage en commerce ou gestion.
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2. Groupe Alternance Besançon

Même réseau, autre territoire. Le campus de Besançon propose des cursus similaires (BTS MCO, BTS NDRC, Bachelor), mais avec un ancrage franc-comtois qui ouvre des portes auprès des entreprises du Doubs et du Jura.
Pour un apprenti qui vit dans l’est de la région et ne souhaite pas se déplacer jusqu’à Dijon, c’est une option cohérente. Le maillage local avec les PME de la zone reste un atout concret au moment de signer un contrat.
3. CMA Bourgogne Franche-Comté

La Chambre de Métiers et de l’Artisanat propose plus de mille offres d’apprentissage sur la région, selon ses propres relais. Ses CFA forment aux métiers de l’artisanat : boulangerie, coiffure, mécanique auto, bâtiment, alimentation.
Le réseau CMA reste la porte d’entrée principale pour les métiers manuels et les CAP. Public cible : les jeunes dès 16 ans qui veulent apprendre un métier technique avec un diplôme professionnel reconnu par la branche artisanale.
4. Afpa Bourgogne-Franche-Comté

L’Afpa dispose de sept centres dans la région, et propose des parcours en alternance orientés vers les demandeurs d’emploi et les adultes en reconversion. Les filières couvrent le bâtiment (gros et second œuvre), l’industrie, la logistique et le tertiaire.
Ce qui distingue l’Afpa, c’est sa capacité à accueillir des profils qui ne sortent pas du système scolaire classique. Contrat de professionnalisation et reconversion adulte sont au cœur du dispositif. Les retours varient sur le rythme selon les centres, mais l’encadrement terrain est solide.
5. Groupe Alternance Mâcon

Le campus de Mâcon complète la couverture sud de la région pour le Groupe Alternance. Il cible les étudiants de Saône-et-Loire qui cherchent un BTS ou un bachelor en commerce, ressources humaines ou communication.
L’avantage géographique est réel : éviter les trajets vers Lyon ou Dijon pour accéder à un cursus équivalent. Le placement en entreprise s’appuie sur le réseau économique du Mâconnais et du Beaujolais.
6. Groupe Alternance Auxerre

Auxerre couvre le nord-ouest de la Bourgogne-Franche-Comté, un secteur où l’offre de formation en alternance est moins dense. Les formations proposées restent centrées sur le tertiaire et le commerce.
Pour les apprentis de l’Yonne, c’est souvent la seule école d’alternance privée accessible sans déménager. Un critère qui pèse lourd quand on a 18 ans et pas de permis.
7. Groupe Alternance Lons-le-Saunier

Même logique de proximité dans le Jura. Le campus de Lons-le-Saunier dessert un bassin où l’alternance en commerce et gestion manquait d’offre locale. Les cursus suivent le catalogue national du réseau.
Le public visé : bacheliers jurassiens qui veulent combiner formation supérieure et expérience en entreprise sans quitter leur département.
8. Formaposte (alternance Groupe La Poste en Bourgogne-Franche-Comté)

Formaposte forme des alternants directement pour les métiers du Groupe La Poste : distribution, relation client, banque postale, logistique. Le contrat est signé avec La Poste, ce qui garantit un employeur solide pendant toute la durée de la formation.
- Spécialités : métiers du courrier, de la banque et du commerce en bureau de poste
- Niveau d’entrée : du CAP au licence professionnelle selon les parcours
- Condition spécifique : avoir 18 ans minimum pour intégrer le dispositif au sein du Groupe La Poste
On s’adresse ici à ceux qui cherchent un employeur garanti dès la signature du contrat d’alternance.
9. CFA de l’Éducation nationale en Bourgogne-Franche-Comté

Les CFA rattachés à l’Éducation nationale fonctionnent au sein des lycées professionnels de la région. Ils préparent à des CAP, bacs pro et BTS dans des filières industrielles, tertiaires ou agricoles.
Leur force : un cadre pédagogique structuré et des plateaux techniques souvent bien équipés. Le public cible reste les jeunes de 16 à 25 ans qui préfèrent un environnement scolaire encadré à une école privée.
10. ANAF Bourgogne-Franche-Comté (accompagnement et mentorat)

L’Association nationale des apprentis de France n’est pas un CFA, mais son programme de mentorat a accompagné plus de 380 jeunes dans la région en 2025. L’ANAF aide à trouver un contrat, à résoudre les difficultés en entreprise et à éviter les ruptures.
C’est un complément à toute formation listée ci-dessus. Un apprenti qui galère à trouver une entreprise ou à tenir son contrat a tout intérêt à se rapprocher de ce réseau.
- Mentorat individualisé pour décrocher et maintenir un contrat d’alternance
- Présence active sur le territoire bourguignon et franc-comtois
- Accessible quel que soit le CFA ou l’organisme de formation choisi
Le marché de l’alternance montre des signes de tension depuis le début de l’année, avec une baisse des offres constatée à l’échelle nationale. Choisir un établissement bien implanté localement et doté d’un réseau d’entreprises partenaires reste le meilleur moyen de sécuriser son parcours en Bourgogne-Franche-Comté.

